Ерлан Кожагапанов окончил Карагандинский государственный университет, Алматинский государственный университет, Российскую Таможенную академию Государственного Таможенного комитета РФ. В 1990–1994 годы занимался предпринимательской деятельностью. В 1994–2007 года работал в государственных органах и предприятиях.
В 2007–2013 годы занимал должность заместителя акима города Астана. В 2013–2016 годы работал председателем агентства по делам спорта и физической культуры, президентом Федерации футбола.
С декабря 2016 года и по настоящее время занимал должность советника премьер-министра.