Сергей Коновалов в разные годы работал в Институте философии и политологии Национальной Академии наук РК, главным специалистом департамента внутренней политики министерства культуры, информации и общественного согласия РК, был главным экспертом секретариата Совета безопасности РК, работал в структуре администрации президента РК. В 2016-2018 гг. заведовал сектором секретариата совбеза. До нового назначения с марта 2018 года занимал должность заместителя заведующего отделом общих вопросов безопасности Совета безопасности РК.