Ермек Кошербаев в разные годы работал на различных должностях в МИД Каз ССР, Администрации президента РК, правительстве РК, МИД РК, НДП «НурОтан», НК АО «КазМунайГаз», возглавлял АО НК «СПК «Ертіс», был первым заместителем акима Восточно-Казахстанской области, вице-министром сельского хозяйства, ответственным секретарем МСХ. С мая 2018 года, он был ответственным секретарем МИД. Президент освободил его от этой должности.