Серик Шапкенов родился в 1979 году в Западно-Казахстанской области в с. Каратобе. Окончил Западно-Казахстанский государственный университет по специальности «Экономист-математик». Трудовую деятельность начал в 2000 году преподавателем в этом же вузе, после в разные годы работал в структуре аппарата акима Западно-Казахстанской области, был первым заместителем акима региона, госинспектором отдела государственного контроля и организационно-территориальной работы администрации президента, акимом Атырау. С 2018 года занимал должность первого заместителя акима Атырауской области.