Ранее Наиль Ахметзакиров возглавлял департамент по обеспечению деятельности судов Верховного суда. Этот департамент преобразован в судебную администрацию, которая является уполномоченным государственным органом в сфере судебного администрирования, осуществляющим организационно-правовое, информационно-аналитическое и материально-техническое обеспечение деятельности Верховного суда, местных и других судов. Она занимается разработкой и совершенствованием государственной политики в сфере судебного администрирования, разработкой системных реформ, направленных на совершенствование судебной системы и деятельности судов. В структуре судебной администрации также есть аппарат Верховного суда.