Марат Азильханов в разные годы служил в органах национальной безопасности, был председателем Агентства по делам религий, вице-министром культуры и спорта, ответсекретарем министерства по делам религий и гражданского общества, министерства общественного развития. В апреле 2019 года был назначен вице-министром информации и общественного развития.