Канатбек Сафинов родился 24 марта 1962 года в селе Бурное Джамбулской области, окончил Казахский государственный университет им. С.М. Кирова. Должность ответственного секретаря министерства нефти и газа занимает с марта 2010 года.
С ноября 1999 года исполнял обязанности заведующего отделом законодательства, обороны и правопорядка канцелярии премьер-министра. С февраля 2002 года – заместитель генерального директора ЗАО «НК «КазТрансОйл», с марта 2002 года – управляющий директор ЗАО «НК «КазМунайГаз».
В 2006 году назначен управляющим директором АО «Казахстанский холдинг по управлению государственными активами «Самрук». С 2008 года – управляющий директор, член правления АО «ФНБ «Самрук-Қазына». С 2009 года – ответственный секретарь министерства энергетики и минеральных ресурсов.