Согласно указа, аппарат будет заниматься координацией центральных и местных исполнительных органов, а также организационно-правовым, экспертно-аналитическим, кадровым, информационным и материально-техническим обеспечением деятельности премьер-министра и правительства.
Канцелярией премьер-министра с марта 2019 года руководит Галымжан Койшибаев.