Гани Мурзаханов родился 15 декабря 1966 года. Окончил Алма-Атинский автомобильно-дорожный институт. Трудовую деятельность начал в 1991 году инженером-технологом лаборатории керамических материалов Алма-Атинского НИИ СТРОМПРОЕКТа. В разные годы работал в АО «Жамбыл Жолдары», пройдя путь от мастера до руководителя, занимал руководящие должности в Ассоциации «Корпорация «Прогресс», имеет опыт в государственной службе, в частности, с 2008 по 2016 годы являлся заместителем руководителя управления пассажирского транспорта и автомобильных дорог города Алматы. До нового назначения был директором ГКП «Алматы тазалық».