«Последние события на кыргызско-казахской границе показали, что мы возлагали слишком большие надежды на ЕАЭС. Конечно, несмотря ни на что, и теперь, и в будущем стратегическим партнером и надежным союзником остается братская Россия. Но не может быть надежным союз, если он зависит от прихоти одного человека, даже самого великого», — заявил Атамбаев.
Президент Кыргызстана добавил, что поручит правительству найти альтернативные рынки сбыта — Узбекистан и Китай. Отечественным производителям промышленных товаров он посоветовал отгружать товары в Россию через железную дорогу и пломбировать вагоны.
10 октября Казахстан усилил контроль на границе с Кыргызстаном, ссылаясь на меры безопасности, которые приняты на случай беспорядков после окончания голосования в соседней стране. В связи с чем на кыргызско-казахской границе образовались длинные очереди из людей, транспортных средств и грузов. Атамбаев, в свою очередь, заявил, что усиление контроля на границе нарушает нормы и соглашения Евразийского экономического союза.
15 октября в Киргизии прошли выборы президента, по результатам автоматической обработки бюллетеней уверенную победу одержал Сооронбай Жээнбеков, который получил 54,81% голосов от общего числа избирателей в 1,692 млн. человек. Но окончательные результаты ЦИК страны объявит только через 20 дней, после окончания ручного пересчёта.
15 октября Алмазбек Атамбаев заявил о намерении созвать внеочередное заседание глав стран Евразийского экономического союза, если контрольно-пропускные пункты на кыргызско-казахской границе не будут открыты в течение двух-трех дней.
19 октября Казахстан и Кыргызстан договорились об устранении заторов на границе, был определен приоритетный порядок пересечения границы.
23 октября министерство иностранных дел Кыргызстана уведомило казахстанских дипломатов о начале внутригосударственных процедур по денонсации (расторжению) соглашения между правительствами двух стран о развитии экономического сотрудничества, которое было подписано 26 декабря 2016 года. О намерении отказаться от помощи Казахстана ранее заявил уходящий президент Кыргызстана Алмазбек Атамбаев.